Este joven delantero se ha convertido en uno de los mejores delanteros del fútbol chileno e ídolo indiscutido de Universidad Católica, uno de los tres grandes del fútbol chileno, equipo del que incluso se convirtió en su capitán.

Sus principales características, son su fuerza física, su enganche y su potencia, además de su excelente definición ante el pórtico rival.

Hijo del recordado Hugo Eduardo "Pájaro" Rubio, este atacante inició su carrera en las cadetes de Colo Colo en 1998, donde sólo estuvo un año para emigrar a Universidad Católica, club en el que definitivamente se formaría como profesional.

En las inferiores del club cruzado, "Edu", como se le conoce en el mundo futbolístico, destacó rápidamente por su calidad y su gran visión de juego que le permitió ser siempre goleador en las series que defendía. Así, ganar los campeonato en las series menores se hacía costumbre, al igual que alzar el trofeo al máximo goleador.

No era extraño, que comenzara a frecuentar las nominaciones de la Selecciones chilenas menores, participando en la sub 20 en distintos amistoso y en el sudamericano jugado el 2003 en Uruguay, donde Chile no tuvo una buena participación y quedó eliminado en primera ronda, pero la actuación de Rubio fue lo más rescatable y su juego fue alabado por la prensa internacional.

Con Universidad Católica ya había debutado en el 2002, jugando 45 minutos ante Unión Española el 27 de Octubre. Ese año jugó dos partido más, ante Audax Italiano y Cobreloa, casi al fin de la temporada, lo que ya indicaba que estaba empezando a ser tomado en cuenta en el primer equipo.

Luego , en 2003, definitivamente llegó su gran oportunidad bajo las órdenes del nuevo técnico Oscar Meneses, "Edu" tuvo mayores chances de jugar, y conquistó la titularidad para no dejarla más , tanto en el torneo local como en la Copa Libertadores, donde Rubio ya destacó como uno de los mejores elementos del conjunto estudiantil y fue la gran revelación del torneo.

Luego de esos vinieron años muy buenos con el Edu confirmando su madurez y su calidad que lo convirtió en ídolo del equipo gracias a sus goles que llevaron al equipo de la franja a convertirse en campeón el 2005, convirtiéndose en el goleador del equipo.

Tras el 2006, su buen nivel llevo a que equipos del extranjero se fijarán en él desde Europa y Argentina, pero al final decidió fichar en el Cruz Azul, uno de los cuadros grandes de México donde el talentoso ariete continuó su carrera.

Volvió en el 2007 a jugar en el club más grande de Chile, el Colo Colo, donde tuvo muy buenas actuaciones, lo que lo levó a ser considerado por el técnico de la selección nacional, Marcelo Bielsa, para ser parte del plantel que disputa las Eliminatorias para Sudafrica 2010.

Sus buenas actuaciones le permitieron partir a Europa para jugar en el Basilea de Suiza, donde cumplió muy buenas campañas logrando clasificar incluso para la Champions League, torneo en el que el chileno logró destacar, a pesar de que su club no logró pasar la primera ronda.

El 2010 vuelve a Chile y firma en la Unión Española, club en el que actualmente milita.